Curriculum Vitae | السيرة الذاتية

Dr. Mohammed Abdullah Alqumber

Summary

Associate Professor in medical microbiology at Albaha University, Saudi Arabia. Published in many international journals, and hold an international patent. Enjoy teaching and learning new methods, and have developed several open educational resources including a YouTube channel (www.youtube.com/DrAlqumber, which attracted 3733 subscribers), and an eLearning website: https://drqumber.wordpress.com/e_learning/.

Relevant Experience

2/2015 – now                Associate Professor

                                     Head of Quality Control Unit, Faculty of Medical Sciences

Albaha University, Saudi Arabia

2010-2014                    Assistant Professor

                                     Head of Laboratory Medicine Department, Faculty of Medical Sciences

Albaha University, Saudi Arabia

12/04 –3/10                 Part Time Tutor, Demonstrator and Research Assistant

Department of Microbiology & Immunology, University of Otago, NZ

11/02 – 03/03              Laboratory Investigator

BLIS Technologies Ltd, Centre For Innovation

University of Otago, New Zealand

03/03 – 11/09              Postgraduate Student         

School of Medical Sciences, University of Otago, New Zealand

 

  • Isolated and identified disease causing bacteria
  • Expressed, purified & characterised a novel bacteriolytic enzyme
  • Developed novel enzyme activity assay
  • Established monitoring protocols during protein purification
  • Increased yield by identifying & eliminating poor purification steps
  • SDS-PAGE and modified SDS-PAGE activity gels
  • Utilized HPLC, MALDI-TOF and MS/MS coupled with NMR for complete structural elucidations.

Some Skills & Expertise

Molecular Biology

  • Sequencing & data analysis
  • DNA & RNA extraction
  • PCR, real-time PCR, cloning & southern analysis
  • Bioinformatics: primer design & sequence manipulation
  • Transposon & allelic exchange mutagenesis

Protein Purification

  • Enzyme assays
  • SDS-PAGE
  • Chromatography: FPLC, TLC, HPLC, Gel filtration
  • Membrane purification

  Bacteriology & Cell biology

  • Excellent aseptic technique, tissue culture and cell line maintenance
  • Media preparation and strain maintenance & isolation
  • Immunoprecipitation
  • Handling of pathogens: MAP, MRSA, VRSA, VRE, streptococci
  • High throughput screening of antimicrobial compounds
  • Subcellular fractionation

   Some General Skills

  • Professional accounting and budgeting (financial literacy)
  • Articulate public speaker
  • Computer literate: Windows OS, Mac OS & Linux. Proficient in the use of many softwares   (Dreamweaver, Frontpage, Omnigraffle, Adobe Illustrator, Photoshop). Touch typist (50 wpm).

Have a YouTube channel: www.youtube.com/DrAlqumber showing my lectures in Saudi Arabia 

Selected Publications

2) International patent

Co-inventor of skin treatment compositions with BLIS Technologies Limited (International Publication No. WO/2006/104403), http://www.wipo.int/pctdb/en/wo.jsp?wo=2006104403

2) Published Books

Antibiotics and Probiotics, Mohammed A. Alqumber, LAP Lambert Academic Publishing, 8 October 2014.

3) Selected Peer Reviewed Articles

Mohammed A Alqumber, Khaled A Arafa: Site-specific mouth rinsing can improve oral odor by altering bacterial counts. Blind crossover clinical study. Saudi medical journal 2014; 35(11):1412-6.

Mohammed A. Alqumber, Hassan A. Alqumber: Surgeons’ Microbiological Attitudes and Knowledge. Life Science Journal 2014; 11(9):1041-1044.

Mohammed A Alqumber: Clostridium difficile in retail baskets, trolleys, conveyor belts, and plastic bags in Saudi Arabia.. Saudi medical journal 2014; 35(10):1274-7.

Mohammed A. Alqumber: Operational Research into Microbiological Diagnoses in Saudi Arabia. Life Science Journal 2014; 11(9):1045-1050.

Mohammed Alqumber: Parasitic Contamination in Raw Vegetables in Cities of the Sarawat Mountain Range of Saudi Arabia. Life Science Journal 2014; 11(9):707-711.

Mohammed Alqumber: Listeria monocytogenes in Food Outlets: Prevalence and Spread During the Purchasing Process. American Journal of Science 2014.

Mohammed Alqumber: The Effect of Salvadora persica L. Sticks on Bacterial Counts and Oral Odor: A Crossover Clinical Study. Life Science Journal 2014; 11(10):44-48.

Mohammed A Alqumber: Prevalence of mycobacteria in water reservoirs of Albaha, Saudi Arabia. Saudi medical journal 2014; 35(5):466-71.

Mohammed A Alqumber, Sajad Ahmad Dar, Shafiul Haque, Mohd Wahid, Rohit Singh, Naseem Akhter: No Association of the TGF-β1 29T/C Polymorphism with Breast Cancer Risk in Caucasian and Asian Populations: Evidence from a Meta-Analysis Involving 55, 841 Subjects.. Asian Pacific journal of cancer prevention: APJCP 2014; 15(20):8725-34.

Mohammed A A Alqumber, Naseem Akhter, Shafiul Haque, Aditya K Panda, Raju K Mandal: Evaluating the Association between p53 Codon 72 Arg>Pro Polymorphism and Risk of Ovary Cancer: A Meta-Analysis.. PLoS ONE 2014; 9(4):e94874.

Raju K Mandal, Naseem Akhter, Shafiul Haque, Aditya K Panda, Rama D Mittal, Mohammed A A Alqumber: No Correlation between TIMP2 -418 G>C Polymorphism and Increased Risk of Cancer: Evidence from a Meta-Analysis. PLoS ONE 2014; 9(8):e88184.

Mohammed A A Alqumber, Raju K Mandal, Shafiul Haque, Aditya K Panda, Naseem Akhter, Arif Ali: A Genetic Association Study of CCL5 -28 C>G (rs2280788) Polymorphism with Risk of Tuberculosis: A Meta-Analysis. PLoS ONE 2013; 8(12):e83422.

M.A. Alqumber, J.P. Burton, Celia Devenish, J.R. Tagg: A species-specific PCR for Lactobacillus iners demonstrates a relative specificity of this species for vaginal colonization. Microbial Ecology in Health and Disease 2008; 20(3):135-139.

Jens Walter, Diane M Loach, Mohammed Alqumber, Christoph Rockel, Corinna Hermann, Markus Pfitzenmaier, Gerald W Tannock: D-alanyl ester depletion of teichoic acids in Lactobacillus reuteri 100-23 results in impaired colonization of the mouse gastrointestinal tract.. Environmental Microbiology 2007; 9(7):1750-60.

Ellen De Backer, Rita Verhelst, Hans Verstraelen, Mohammed A Alqumber, Jeremy P Burton, John R Tagg, Marleen Temmerman, Mario Vaneechoutte: Quantitative determination by real-time PCR of four vaginal Lactobacillus species, Gardnerella vaginalis and Atopobium vaginae indicates an inverse relationship between L. gasseri and L. iners.. BMC Microbiology 2007; 7:115.

M Al-Qumber, J R Tagg: Commensal bacilli inhibitory to mastitis pathogens isolated from the udder microbiota of healthy cows.. Journal of Applied Microbiology 2006; 101(5):1152-60.

Jeremy P Burton, Chris N Chilcott, Mohammed Al-Qumber, Heather J L Brooks, Don Wilson, John R Tagg, Celia Devenish: A preliminary survey of Atopobium vaginae in women attending the Dunedin gynaecology out-patients clinic: is the contribution of the hard-to-culture microbiota overlooked in gynaecological disorders?. Australian and New Zealand Journal of Obstetrics and Gynaecology 2005; 45(5):450-2.

Mohammed A. Al-Qumber: Bovine mastitis and human vaginosis : exploring control methods based upon the use of probiotics and bacteriocin-like inhibitory substances : a thesis submitted for the degree of Master of Science at the University of Otago, Dunedin, New Zealand.

  د/ محمد بن عبدالله آل قمبر باحث واستشاري متخصص في علم الأحياء الطبية الدقيقة والمناعة وتقنيات المختبرات الطبية، متميز في الكتابة و التدريس (حاضر في جامعة اتاقو و فلبس في نيوزلندا و المانيا وجامعة الباحة علي التولي (حائز علي براءة إختراع دولية ونشر في المجلات الدولية و قدم في مؤتمرات علمية دولية). حريص على العمل في المجال الأكاديمي والمساهمة في الإنجازات العلمية الطبية في المملكة العربية السعودية في علم الجراثيم ، الفيروسات والطفيليات وتقنيات المختبرات الطبية.

خبرات 

١٠ / ٦ / ٢٠١٤  حتى تاريخه

مشرف وحدة الجودة بكلية العلوم الطبية التطبيقية ، جامعة الباحة

٤ / ٢٠١٠ إلى ٦ / ٢٠١٤
رئيس قسم طب المختبرات ، كلية العلوم الطبية التطبيقية ، جامعة الباحة

     ٢٠٠١ إلى ٢٠٠٩

  باحث علمي  ، قسم الأحياء الدقيقة والمناعة ، كلية العلوم الطبية ، جامعة أوتاغو ، نيوزيلندا

  ٢٠٠٩ إلى ٢٠١٠

 زمالة (بعد الدكتوراه) ، قسم الأحياء الدقيقة والمناعة ، كلية العلوم الطبية ، جامعة أوتاغو ، نيوزيلندا

٢٠٠٣ إلى ٢٠٠٤

 باحث ، شركة المعايير الأساسية للتكنولوجيا و الابتكار ،  جامعة أوتاغو ، نيوزيلندا

المؤهلات

دكتوراه  كلية العلوم الطبية ، جامعة أوتاغو ، نيوزيلندا

ماجستير كلية العلوم الطبية ، جامعة أوتاغو ، نيوزيلندا

بكالوريوس كلية العلوم الطبية ، جامعة أوتاغو ، نيوزيلندا

شهادة العلوم الطبية الأساسية, جامعة الملك عبدالعزيز ، جدة ، المملكة العربية السعودية

شهادة حفظ الطعام, كلية العلوم الطبية ، جامعة أوتاغو ، نيوزيلندا

شهادة المحاسبة, غرفة أوتاغو التجارية ، نيوزيلندا

شهادة دعم الحياة الأساسية الانعاش القلبي, مركز بابطين للقلب، المملكة العربية السعودية

ملخص لبعض المهارات الدقيقة

البيولوجيا الجزيئية و بيولوجيا الخلية :أ)  استخراج وتحليل بيانات الحمض النووي ، ب)  صناعة الانزيمات النافعه و االهندسة الجينيه ، ت)  زراعة الأنسجة

تنقية البروتينات و الأنزيمات :أ) قياسات الأنزيمات ، ب)  التنقية بالكروماتوغرافي: GC، FPLC ،TLC, HPLC, Gel filtration والتنقية بالأغشية

علم الجراثيم و الوبائيات :أ) زراعة الجراثيم و تصنيفها ، ب) اعداد الشرائح و الصبغات المجهرية ، ت) معالجة العوامل المسببة للأمراض ، ث) فحص المركبات المضادة للميكروبات

المهارات العامة :أ) تحليل البيانات وتصميم  البروتوكولات ، ب) المحاسبة ، ت) بارع في استخدام برامج كثيرة (ماكنتوش , دريمويفر ، فرونت بيج ، Omnigraffle ، أدوبي المصور ، فوتوشوب). سريع الكتابة علي لوحة المفاتيح : 50 كلمة في الدقيقة. و قد أسست مواقع إلكترونية.

براءة اختراع/المنشورات

Journal Publications | البحوث المنشورة ضمن المجلات العلمية المحكمة

Systematic Medical Terminology Book |كتاب المصطلحات الطبية المنظومة منطقياً

Antibiotics & Probiotics Book | كتاب المضادات الحيوية والخثرات الطبية

Skin Treatment Composition Patent | براءة اختراع لعلاج امراض الجلد

Youtube Channel | القناة اليوتيوبية

Bacteriology Lectures | محاضرات علم الجراثيم

5 comments on “Curriculum Vitae | السيرة الذاتية

  1. السلام عليكم
    اني عمر موفق من العراق
    طالب دراسات عليا في اختصاص الاحياء المجهرية
    معجب بمحاظراتك المنشورة على اليوتيوب

  2. ما شاء الله تبارك الله يا د. محمد انا فعلا معجب بطريقة شرحك وتوصيلك للمعلومة وعرضك للفديو أتمنى منك الاستمرار ليس فقط في عروض الجانب النظري من الميكروبيولوجي ولكن أيضا في الجانب العملي.

Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out /  Change )

Google photo

You are commenting using your Google account. Log Out /  Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out /  Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out /  Change )

Connecting to %s